1972年に、その前身である大阪難病者団体連絡協議会として結成され、 総合的難病対策の確立を求める活動を展開しています。
大阪府より大阪難病相談支援センターを委託され、難病患者およびそのご家族、関係者からの相談業務、医療講演会や福祉講演会の開催、就労相談や交流会等、幅広い支援を行っています。
さらに大阪難病連では、大阪府議会請願署名や大阪市会陳情書の提出、大阪府への要望書提出（応接懇談実施）、政党との意見交換会、難病対策地域協議会等への参加、機関誌「大阪なんれん」発行など、社会啓発活動も盛んに行っています。
現在、大阪府内の患者会を中心に25団体が加盟しています。